Bonjour,
Si ça peut t'aider, voilà ce qui est fait en géneral en pisciculture pour traiter directement un bassin... En fait, on coupe l'arrivée d'eau (ou on réalise une dérivation) afin de maintenir la concentration du produit, on baisse le niveau au maximum (je ne sais pas si c'est possible dans ton cas) et on répartit le produit autant que possible dans le bassin. On laisse agir un certain temps selon le traitement, puis on rétablit l'arrivée d'eau. (Avec si possible un début maximal) Et on réalise plutôt le traitement quand il ne fait pas trop chaud (en ce moment, ça va. ^^)
D'après ce que tu décris, il y a de fortes chances pour que tes carpes aient une columnariose (Flavobacterium columnare). Il y a différents antibiotiques qui peuvent être utilisés (la streptomycine, les tétracyclines, les sulfamides, l'érythromycine et la fluméquine, notament). Mais de toutes façons, pour un tel volume, c'est uniquement sur préscription véterinaire! Je te conseille donc de trouver un véto compétent dans ce domaine. (si tu as une pisciculture à proximité de chez toi, tu peux leur demander conseil)
Mais sans vouloir être pessimiste, ce genre de traitement fait rarement des miracles... Surtout si l'étang est envasé.